В данном случае, похоже, процесс автоматического обновления конфигурации был случайно или преднамеренно прерван пользователем. Для решения проблемы нужно снять блокировку, и повторить обновление (обновление лучше проводить откатившись к резервной копии базы данных, сделанной до обновления).
Действия по решению проблемы зависят от варианты режима работы:
1) Файл-серверный режим работы базы. Для того, чтобы снять блокировку — удалите файл 1Cv8.cdn, который лежит в каталоге ИБ. После снятия блокировки, повторите попытку обновления.
2) Клиент-серверный режим. Снимите блокировку в консоли серверов в свойствах ИБ. После снятия блокировки, повторите попытку обновления.